Il-kanċer tal-frixa huwa wieħed mill-aktar tumuri fatali fid-dinja bi pronjosi ħażina.Għalhekk, mudell ta 'tbassir preċiż huwa meħtieġ biex jiġu identifikati pazjenti f'riskju għoli ta' kanċer tal-frixa biex jitfassal it-trattament u jtejjeb il-pronjosi ta 'dawn il-pazjenti.
Aħna ksibna dejta RNAseq ta 'The Cancer Genome Atlas (TCGA) pancreatic adenocarcinoma (PAAD) mid-database UCSC Xena, identifikajna lncRNAs relatati mal-immunità (irlncRNAs) permezz ta' analiżi ta 'korrelazzjoni, u identifikajna differenzi bejn TCGA u tessuti normali tal-adenokarċinoma tal-frixa.DEirlncRNA) minn TCGA u espressjoni tat-tessut tal-ġenotip (GTEx) tat-tessut tal-frixa.Saru aktar analiżi ta' rigressjoni univarjata u lasso biex jinbnew mudelli ta 'firma pronjostiċi.Imbagħad ikkalkulajna l-erja taħt il-kurva u ddeterminajna l-aħjar valur ta 'qtugħ għall-identifikazzjoni ta' pazjenti b'adenokarċinoma tal-frixa ta 'riskju għoli u baxx.Biex tqabbel karatteristiċi kliniċi, infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni, mikroambjent immunosoppressiv, u reżistenza għall-kimoterapija f'pazjenti b'kanċer tal-frixa ta 'riskju għoli u baxx.
Aħna identifikajna 20 pari DEirlncRNA u gruppajna pazjenti skont l-aħjar valur tal-qtugħ.Aħna wrejna li l-mudell tal-firma pronjostika tagħna għandu prestazzjoni sinifikanti fit-tbassir tal-pronjosi ta 'pazjenti b'PAAD.L-AUC tal-kurva ROC hija 0.905 għat-tbassir ta 'sena, 0.942 għat-tbassir ta' 2 snin, u 0.966 għat-tbassir ta '3 snin.Pazjenti b'riskju għoli kellhom rati ta' sopravivenza aktar baxxi u karatteristiċi kliniċi agħar.Aħna wrejna wkoll li pazjenti b'riskju għoli huma immunosoppressi u jistgħu jiżviluppaw reżistenza għall-immunoterapija.Evalwazzjoni ta' mediċini kontra l-kanċer bħal paclitaxel, sorafenib, u erlotinib ibbażata fuq għodod ta' tbassir komputazzjonali tista' tkun xierqa għal pazjenti b'riskju għoli b'PAAD.
B'mod ġenerali, l-istudju tagħna stabbilixxa mudell ta 'riskju pronjostiku ġdid ibbażat fuq irlncRNA paired, li wera valur pronjostiku promettenti f'pazjenti b'kanċer tal-frixa.Il-mudell tar-riskju pronjostiku tagħna jista 'jgħin biex jiddifferenzja pazjenti b'PAAD li huma adattati għal trattament mediku.
Il-kanċer tal-frixa huwa tumur malinn b'rata ta 'sopravivenza baxxa ta' ħames snin u grad għoli.Fiż-żmien tad-dijanjosi, ħafna mill-pazjenti diġà jinsabu fi stadji avvanzati.Fil-kuntest tal-epidemija tal-COVID-19, it-tobba u l-infermiera huma taħt pressjoni enormi meta jittrattaw pazjenti bil-kanċer tal-frixa, u l-familji tal-pazjenti wkoll jiffaċċjaw pressjonijiet multipli meta jieħdu deċiżjonijiet dwar it-trattament [1, 2].Għalkemm saru avvanzi kbar fit-trattament tad-DOADs, bħal terapija neoadjuvanti, risezzjoni kirurġika, terapija bir-radjazzjoni, kimoterapija, terapija molekulari mmirata, u inibituri tal-punti ta 'kontroll immuni (ICIs), madwar 9% biss tal-pazjenti jgħixu ħames snin wara d-dijanjosi [3] ].], 4].Minħabba li s-sintomi bikrija tal-adenokarċinoma tal-frixa huma atipiċi, il-pazjenti ġeneralment jiġu djanjostikati b'metastasi fi stadju avvanzat [5].Għalhekk, għal pazjent partikolari, trattament komprensiv individwalizzat għandu jiżen il-vantaġġi u l-iżvantaġġi tal-għażliet kollha ta 'trattament, mhux biss biex ittawwal is-sopravivenza, iżda wkoll biex ittejjeb il-kwalità tal-ħajja [6].Għalhekk, mudell ta 'tbassir effettiv huwa meħtieġ biex tiġi evalwata b'mod preċiż il-pronjosi ta' pazjent [7].Għalhekk, jista’ jintgħażel trattament xieraq biex jibbilanċja s-sopravivenza u l-kwalità tal-ħajja tal-pazjenti b’PAAD.
Il-pronjosi ħażina ta 'PAAD hija prinċipalment dovuta għar-reżistenza għall-mediċini tal-kimoterapija.F'dawn l-aħħar snin, l-inibituri tal-punti ta 'kontroll immuni ntużaw ħafna fit-trattament ta' tumuri solidi [8].Madankollu, l-użu tal-ICIs fil-kanċer tal-frixa rari jirnexxi [9].Għalhekk, huwa importanti li jiġu identifikati pazjenti li jistgħu jibbenefikaw mit-terapija ICI.
RNA twil mhux kodifikanti (lncRNA) huwa tip ta 'RNA mhux kodifikanti bi traskrizzjonijiet> 200 nukleotide.LncRNAs huma mifruxa u jikkostitwixxu madwar 80% tat-traskriptoma uman [10].Korp kbir ta 'xogħol wera li mudelli pronjostiċi bbażati fuq lncRNA jistgħu jbassru b'mod effettiv il-pronjosi tal-pazjent [11, 12].Pereżempju, ġew identifikati 18 lncRNAs relatati mal-awtofaġija biex jiġġeneraw firem pronjostiċi fil-kanċer tas-sider [13].Sitt lncRNAs oħra relatati mal-immunità intużaw biex jistabbilixxu l-karatteristiċi pronjostiċi tal-glijoma [14].
Fil-kanċer tal-frixa, xi studji stabbilixxew firem ibbażati fuq lncRNA biex ibassru l-pronjosi tal-pazjent.Firma 3-lncRNA ġiet stabbilita f'adenokarċinoma pankreatika b'erja taħt il-kurva ROC (AUC) ta '0.742 biss u sopravivenza ġenerali (OS) ta' 3 snin [15].Barra minn hekk, il-valuri tal-espressjoni tal-lncRNA ivarjaw fost ġenomi differenti, formati ta 'dejta differenti, u pazjenti differenti, u l-prestazzjoni tal-mudell ta' tbassir hija instabbli.Għalhekk, nużaw algoritmu ġdid ta 'mudellar, tqabbil u iterazzjoni, biex niġġeneraw firem tal-lncRNA (irlncRNA) relatati mal-immunità biex noħolqu mudell ta' tbassir aktar preċiż u stabbli [8].
Id-dejta normalizzata RNAseq (FPKM) u d-dejta tal-kanċer kliniku tal-frixa TCGA u tal-espressjoni tat-tessut tal-ġenotip (GTEx) inkisbu mid-database UCSC XENA ( https://xenabrowser.net/datapages/ ).Fajls GTF inkisbu mid-database Ensembl (http://asia.ensembl.org) u ntużaw biex jiġu estratti profili ta 'espressjoni ta' lncRNA minn RNAseq.Niżżiljna ġeni relatati mal-immunità mid-database ImmPort (http://www.immport.org) u identifikajna lncRNAs relatati mal-immunità (irlncRNAs) bl-użu ta 'analiżi ta' korrelazzjoni (p <0.001, r> 0.4).Identifikazzjoni ta' irlncRNAs espressi b'mod differenzjali (DEirlncRNAs) billi jaqsmu irlncRNAs u lncRNAs espressi b'mod differenzjali miksuba mid-database GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) fil-koorti TCGA-PAAD (|logFC| > 1 u FDR ) <0.05).
Dan il-metodu ġie rrappurtat qabel [8].Speċifikament, aħna nibnu X biex tissostitwixxi l-lncRNA A u lncRNA B imqabbla. Meta l-valur tal-espressjoni tal-lncRNA A huwa ogħla mill-valur tal-espressjoni tal-lncRNA B, X huwa definit bħala 1, inkella X huwa definit bħala 0. Għalhekk, nistgħu niksbu matriċi ta’ 0 jew – 1. L-assi vertikali tal-matriċi jirrappreżenta kull kampjun, u l-assi orizzontali jirrappreżenta kull par DEirlncRNA b’valur ta’ 0 jew 1.
Analiżi ta 'rigressjoni univarjata segwita minn rigressjoni Lasso kienet użata biex tgħarbel pari DEirlncRNA pronjostiċi.L-analiżi tar-rigressjoni tal-lasso użat validazzjoni inkroċjata ta '10 darbiet ripetuta 1000 darba (p <0.05), b'1000 stimuli każwali għal kull ġirja.Meta l-frekwenza ta 'kull par DEirlncRNA qabżet il-100 darba f'1000 ċiklu, il-pari DEirlncRNA ġew magħżula biex jibnu mudell ta' riskju pronjostiku.Imbagħad użajna l-kurva AUC biex insibu l-aħjar valur tal-qtugħ għall-klassifikazzjoni tal-pazjenti PAAD fi gruppi ta 'riskju għoli u baxx.Il-valur AUC ta' kull mudell ġie kkalkulat ukoll u mpinġi bħala kurva.Jekk il-kurva tilħaq l-ogħla punt li jindika l-valur AUC massimu, il-proċess tal-kalkolu jieqaf u l-mudell jitqies bħala l-aħjar kandidat.Inbnew mudelli ta 'kurva ROC ta' 1, 3 u 5 snin.Intużaw analiżi ta 'rigressjoni univarjata u multivarjata biex tiġi eżaminata l-prestazzjoni ta' tbassir indipendenti tal-mudell tar-riskju pronjostiku.
Uża seba 'għodod biex tistudja r-rati ta' infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni, inklużi XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, u CIBERSORT.Id-dejta dwar l-infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni tniżżlet mid-database TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3).Id-differenza fil-kontenut ta 'ċelluli li jinfiltraw immuni bejn il-gruppi ta' riskju għoli u baxx tal-mudell mibni ġiet analizzata bl-użu tat-test Wilcoxon signed-rank, ir-riżultati huma murija fil-graff kwadru.Twettqet analiżi ta 'korrelazzjoni ta' Spearman biex tanalizza r-relazzjoni bejn il-valuri tal-punteġġ tar-riskju u ċ-ċelloli li jinfiltraw l-immunità.Il-koeffiċjent ta 'korrelazzjoni li jirriżulta huwa muri bħala lollipop.Il-limitu tas-sinifikat ġie stabbilit għal p < 0.05.Il-proċedura twettqet bl-użu tal-pakkett R ggplot2.Biex teżamina r-relazzjoni bejn il-mudell u l-livelli ta 'espressjoni tal-ġeni assoċjati mar-rata ta' infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni, wettaqna l-pakkett ggstatsplot u viżwalizzazzjoni tal-plott tal-vjolin.
Biex nevalwaw il-mudelli ta 'trattament kliniku għall-kanċer tal-frixa, aħna kkalkulajna l-IC50 ta' mediċini ta 'kimoterapija użati b'mod komuni fil-koorti TCGA-PAAD.Differenzi f'nofs konċentrazzjonijiet inibitorji (IC50) bejn gruppi ta 'riskju għoli u baxx tqabblu bl-użu tat-test Wilcoxon signed-rank, u r-riżultati huma murija bħala boxplots iġġenerati bl-użu ta' pRRophetic u ggplot2 f'R. Il-metodi kollha jikkonformaw mal-linji gwida u n-normi rilevanti.
Il-fluss tax-xogħol tal-istudju tagħna huwa muri fil-Figura 1. Bl-użu ta 'analiżi ta' korrelazzjoni bejn lncRNAs u ġeni relatati mal-immunità, għażilna 724 irlncRNAs b'p < 0.01 u r > 0.4.Imbagħad analizzajna l-lncRNAs espressi b'mod differenzjat ta 'GEPIA2 (Figura 2A).Total ta '223 irlncRNAs ġew espressi b'mod differenzjali bejn adenokarċinoma tal-frixa u tessut normali tal-frixa (|logFC| > 1, FDR < 0.05), bl-isem DEirlncRNAs.
Kostruzzjoni ta' mudelli ta' riskju ta' tbassir.(A) Plott vulkan ta 'lncRNAs espressi b'mod differenzjali.(B) Distribuzzjoni ta 'koeffiċjenti lasso għal 20 pari DEirlncRNA.(C) Varjazzjoni ta' probabbiltà parzjali tad-distribuzzjoni tal-koeffiċjent LASSO.(D) Plott tal-foresta li juri analiżi ta 'rigressjoni univarjata ta' 20 pari DEirlncRNA.
Imbagħad bnejna matriċi 0 jew 1 billi għaqqad 223 DEirlncRNAs.Ġew identifikati total ta’ 13,687 par DEirlncRNA.Wara analiżi ta 'rigressjoni univarjata u lasso, 20 pari DEirlncRNA ġew finalment ittestjati biex jinbena mudell ta' riskju pronjostiku (Figura 2B-D).Ibbażat fuq ir-riżultati ta 'Lasso u analiżi ta' rigressjoni multipla, aħna kkalkulajna punteġġ tar-riskju għal kull pazjent fil-koorti TCGA-PAAD (Tabella 1).Ibbażat fuq ir-riżultati tal-analiżi tar-rigressjoni tal-lasso, aħna kkalkulajna punteġġ tar-riskju għal kull pazjent fil-koorti TCGA-PAAD.L-AUC tal-kurva ROC kienet 0.905 għat-tbassir tal-mudell tar-riskju ta 'sena, 0.942 għat-tbassir ta' 2 snin, u 0.966 għat-tbassir ta '3 snin (Figura 3A-B).Aħna stabbilixxew valur ta 'qtugħ ottimali ta' 3.105, stratifikajna l-pazjenti tal-koorti TCGA-PAAD fi gruppi ta 'riskju għoli u baxx, u plottajna r-riżultati tas-sopravivenza u d-distribuzzjonijiet tal-punteġġ tar-riskju għal kull pazjent (Figura 3C-E).L-analiżi Kaplan-Meier wriet li s-sopravivenza ta 'pazjenti PAAD fil-grupp ta' riskju għoli kienet sinifikament inqas minn dik ta 'pazjenti fil-grupp ta' riskju baxx (p <0.001) (Figura 3F).
Validità ta' mudelli ta' riskju pronjostiku.(A) ROC tal-mudell tar-riskju pronjostiku.(B) Mudelli ta' riskju pronjostiku ROC ta' 1, 2 u 3 snin.(C) ROC tal-mudell tar-riskju pronjostiku.Juri l-aħjar punt ta' qtugħ.(DE) Distribuzzjoni tal-istatus tas-sopravivenza (D) u l-punteġġi tar-riskju (E).(F) Analiżi Kaplan-Meier ta 'pazjenti PAAD fi gruppi ta' riskju għoli u baxx.
Aħna vvalutajna aktar id-differenzi fil-punteġġi tar-riskju skont il-karatteristiċi kliniċi.Il-plott tal-istrixxa (Figura 4A) turi r-relazzjoni ġenerali bejn il-karatteristiċi kliniċi u l-punteġġi tar-riskju.B'mod partikolari, pazjenti anzjani kellhom punteġġi ta 'riskju ogħla (Figura 4B).Barra minn hekk, pazjenti bi stadju II kellhom punteġġi ta 'riskju ogħla minn pazjenti bi stadju I (Figura 4C).Rigward il-grad tat-tumur f'pazjenti PAAD, pazjenti ta 'grad 3 kellhom punteġġi ta' riskju ogħla minn pazjenti ta 'grad 1 u 2 (Figura 4D).Aħna wettaqna aktar analiżi ta 'rigressjoni univarjata u multivarjata u wrejna li l-punteġġ tar-riskju (p <0.001) u l-età (p = 0.045) kienu fatturi pronjostiċi indipendenti f'pazjenti b'PAAD (Figura 5A-B).Il-kurva ROC wriet li l-punteġġ tar-riskju kien superjuri għal karatteristiċi kliniċi oħra fit-tbassir ta 'sopravivenza ta' 1-, 2-, u 3 snin ta 'pazjenti b'PAAD (Figura 5C-E).
Karatteristiċi kliniċi ta' mudelli ta' riskju pronjostiku.L-istogramma (A) turi (B) età, (C) stadju tat-tumur, (D) grad tat-tumur, punteġġ tar-riskju, u s-sess tal-pazjenti fil-koorti TCGA-PAAD.**p < 0.01
Analiżi ta' tbassir indipendenti ta' mudelli ta' riskju pronjostiku.(AB) Analiżi ta 'rigressjoni univarjata (A) u multivarjata (B) ta' mudelli ta 'riskju pronjostiku u karatteristiċi kliniċi.(CE) ROC ta' 1-, 2-, u 3 snin għal mudelli ta' riskju pronjostiku u karatteristiċi kliniċi
Għalhekk, eżaminajna r-relazzjoni bejn il-ħin u l-punteġġi tar-riskju.Sibna li l-punteġġ tar-riskju f'pazjenti PAAD kien inversament korrelatat ma 'ċelluli T CD8 + u ċelluli NK (Figura 6A), li jindika funzjoni immuni mrażżna fil-grupp ta' riskju għoli.Aħna vvalutajna wkoll id-differenza fl-infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni bejn il-gruppi ta 'riskju għoli u baxx u sibna l-istess riżultati (Figura 7).Kien hemm inqas infiltrazzjoni ta 'ċelluli T CD8 + u ċelluli NK fil-grupp ta' riskju għoli.F'dawn l-aħħar snin, l-inibituri tal-punti ta 'kontroll immuni (ICIs) intużaw ħafna fit-trattament ta' tumuri solidi.Madankollu, l-użu ta 'ICIs fil-kanċer tal-frixa rari kien ta' suċċess.Għalhekk, ivvalutajna l-espressjoni tal-ġeni tal-punti ta 'kontroll immuni fi gruppi ta' riskju għoli u baxx.Sibna li CTLA-4 u CD161 (KLRB1) kienu espressi żżejjed fil-grupp ta 'riskju baxx (Figura 6B-G), li jindika li pazjenti PAAD fil-grupp ta' riskju baxx jistgħu jkunu sensittivi għal ICI.
Analiżi ta 'korrelazzjoni ta' mudell ta 'riskju pronjostiku u infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni.(A) Korrelazzjoni bejn il-mudell tar-riskju pronjostiku u l-infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni.(BG) Tindika l-espressjoni tal-ġeni fi gruppi ta 'riskju għoli u baxx.(HK) Valuri IC50 għal mediċini speċifiċi kontra l-kanċer fi gruppi ta’ riskju għoli u baxx.*p < 0.05, **p < 0.01, ns = mhux sinifikanti
Aħna vvalutajna aktar l-assoċjazzjoni bejn il-punteġġi tar-riskju u l-aġenti komuni tal-kimoterapija fil-koorti TCGA-PAAD.Fittixna mediċini kontra l-kanċer użati b’mod komuni fil-kanċer tal-frixa u analizzajna d-differenzi fil-valuri IC50 tagħhom bejn gruppi ta’ riskju għoli u baxx.Ir-riżultati wrew li l-valur IC50 ta 'AZD.2281 (olaparib) kien ogħla fil-grupp ta' riskju għoli, li jindika li pazjenti PAAD fil-grupp ta 'riskju għoli jistgħu jkunu reżistenti għat-trattament AZD.2281 (Figura 6H).Barra minn hekk, il-valuri IC50 ta’ paclitaxel, sorafenib, u erlotinib kienu aktar baxxi fil-grupp ta’ riskju għoli (Figura 6I-K).Aħna identifikajna wkoll 34 mediċina kontra l-kanċer b'valuri IC50 ogħla fil-grupp ta 'riskju għoli u 34 mediċina kontra l-kanċer b'valuri IC50 aktar baxxi fil-grupp ta' riskju għoli (Tabella 2).
Ma jistax jiġi miċħud li lncRNAs, mRNAs, u miRNAs jeżistu b'mod wiesa 'u għandhom rwol kruċjali fl-iżvilupp tal-kanċer.Hemm evidenza biżżejjed li tappoġġja r-rwol importanti ta 'mRNA jew miRNA fit-tbassir tas-sopravivenza ġenerali f'diversi tipi ta' kanċer.Bla dubju, ħafna mudelli ta 'riskju pronjostiku huma bbażati wkoll fuq lncRNAs.Per eżempju, Luo et al.Studji wrew li LINC01094 għandu rwol ewlieni fil-proliferazzjoni tal-PC u l-metastasi, u espressjoni għolja ta 'LINC01094 tindika sopravivenza fqira ta' pazjenti bil-kanċer tal-frixa [16].L-istudju ppreżentat minn Lin et al.Studji wrew li downregulation ta 'lncRNA FLVCR1-AS1 hija assoċjata ma' pronjosi ħażina f'pazjenti bil-kanċer tal-frixa [17].Madankollu, lncRNAs relatati mal-immunità huma relattivament inqas diskussi f'termini ta 'tbassir tas-sopravivenza ġenerali ta' pazjenti bil-kanċer.Riċentement, ammont kbir ta 'xogħol ġie ffukat fuq il-bini ta' mudelli ta 'riskju pronjostiku biex ibassar is-sopravivenza ta' pazjenti bil-kanċer u b'hekk jaġġustaw il-metodi ta 'trattament [18, 19, 20].Hemm rikonoxximent dejjem akbar tar-rwol importanti tal-infiltrati immuni fil-bidu, il-progressjoni u r-rispons tal-kanċer għal trattamenti bħall-kimoterapija.Bosta studji kkonfermaw li ċ-ċelloli immuni li jinfiltraw it-tumur għandhom rwol kritiku fir-rispons għall-kimoterapija ċitotossika [21, 22, 23].Il-mikroambjent immuni tat-tumur huwa fattur importanti fis-sopravivenza tal-pazjenti tat-tumur [24, 25].L-immunoterapija, speċjalment it-terapija ICI, tintuża ħafna fit-trattament ta 'tumuri solidi [26].Ġeni relatati mal-immunità jintużaw ħafna biex jinbnew mudelli ta' riskju pronjostiku.Per eżempju, Su et al.Il-mudell ta 'riskju pronjostiku relatat mal-immunità huwa bbażat fuq ġeni li jikkodifikaw il-proteini biex ibassar il-pronjosi ta' pazjenti bil-kanċer tal-ovarji [27].Ġeni li ma jikkodifikawx bħal lncRNAs huma wkoll adattati għall-kostruzzjoni ta 'mudelli ta' riskju pronjostiku [28, 29, 30].Luo et al ttestjaw erba 'lncRNAs relatati mal-immunità u bnew mudell ta' tbassir għar-riskju tal-kanċer ċervikali [31].Khan et al.Ġew identifikati total ta '32 traskrizzjonijiet espressi b'mod differenzjat, u abbażi ta' dan, ġie stabbilit mudell ta 'tbassir b'5 traskrizzjonijiet sinifikanti, li ġie propost bħala għodda rakkomandata ħafna għat-tbassir ta' rifjut akut ippruvat minn bijopsija wara trapjant tal-kliewi [32].
Ħafna minn dawn il-mudelli huma bbażati fuq livelli ta 'espressjoni tal-ġeni, jew ġeni li jikkodifikaw il-proteini jew ġeni li ma jikkodifikawx.Madankollu, l-istess ġene jista 'jkollu valuri ta' espressjoni differenti f'ġenomi differenti, formati ta 'dejta u f'pazjenti differenti, li jwasslu għal stimi instabbli f'mudelli ta' tbassir.F'dan l-istudju, bnejna mudell raġonevoli b'żewġ pari ta 'lncRNAs, indipendenti mill-valuri ta' espressjoni eżatti.
F'dan l-istudju, aħna identifikajna irlncRNA għall-ewwel darba permezz ta 'analiżi ta' korrelazzjoni ma 'ġeni relatati mal-immunità.Aħna screened 223 DEirlncRNAs permezz ta 'ibridizzazzjoni ma' lncRNAs espressi b'mod differenzjali.It-tieni, bnejna matriċi 0-or-1 ibbażata fuq il-metodu ta 'tqabbil DEirlncRNA ippubblikat [31].Imbagħad wettaqna analiżi ta 'rigressjoni univarjata u lasso biex nidentifikaw pari DEirlncRNA pronjostiċi u nibnu mudell ta' riskju ta 'tbassir.Aħna analizzajna aktar l-assoċjazzjoni bejn il-punteġġi tar-riskju u l-karatteristiċi kliniċi f'pazjenti b'PAAD.Sibna li l-mudell ta 'riskju pronjostiku tagħna, bħala fattur pronjostiku indipendenti f'pazjenti PAAD, jista' jiddifferenzja b'mod effettiv pazjenti ta 'grad għoli minn pazjenti ta' grad baxx u pazjenti ta 'grad għoli minn pazjenti ta' grad baxx.Barra minn hekk, il-valuri AUC tal-kurva ROC tal-mudell tar-riskju pronjostiku kienu 0.905 għat-tbassir ta 'sena, 0.942 għat-tbassir ta' 2 snin, u 0.966 għat-tbassir ta '3 snin.
Ir-riċerkaturi rrappurtaw li pazjenti b'infiltrazzjoni ogħla taċ-ċelluli T CD8+ kienu aktar sensittivi għat-trattament ICI [33].Żieda fil-kontenut ta 'ċelluli ċitotossiċi, ċelluli CD56 NK, ċelluli NK u ċelluli CD8 + T fil-mikroambjent immuni tat-tumur tista' tkun waħda mir-raġunijiet għall-effett soppressiv tat-tumur [34].Studji preċedenti wrew li livelli ogħla ta 'CD4(+) T u CD8(+) T li jinfiltraw it-tumur kienu assoċjati b'mod sinifikanti ma' sopravivenza itwal [35].Infiltrazzjoni fqira taċ-ċelluli CD8 T, tagħbija baxxa ta 'neoantigen, u mikroambjent tat-tumur immunosoppressiv ħafna jwasslu għal nuqqas ta' rispons għat-terapija ICI [36].Sibna li l-punteġġ tar-riskju kien korrelatat b'mod negattiv ma 'ċelluli T CD8+ u ċelluli NK, li jindika li pazjenti b'punteġġi ta' riskju għoli jistgħu ma jkunux adattati għat-trattament ICI u għandhom pronjosi agħar.
CD161 huwa markatur ta 'ċelluli naturali killer (NK).CD8 + CD161 + ċelluli T trasdotti minn CAR jimmedjaw effikaċja msaħħa in vivo kontra t-tumur f'mudelli ta 'xenograft ta' adenokarċinoma ductal tal-frixa HER2+ [37].L-inibituri tal-punt ta 'kontroll immuni jimmiraw mogħdijiet ta' proteina 4 assoċjata mal-limfoċiti T ċitotossiċi (CTLA-4) u proteina programmata tal-mewt taċ-ċelluli 1 (PD-1)/ligand tal-mewt taċ-ċelluli programmata 1 (PD-L1) u għandhom potenzjal kbir f'ħafna oqsma.L-espressjoni ta 'CTLA-4 u CD161 (KLRB1) hija aktar baxxa fi gruppi ta' riskju għoli, u tindika aktar li pazjenti b'punteġġi ta 'riskju għoli jistgħu ma jkunux eliġibbli għal trattament ICI.[38]
Biex issib għażliet ta 'trattament adattati għal pazjenti b'riskju għoli, analizzajna diversi mediċini kontra l-kanċer u sibna li paclitaxel, sorafenib u erlotinib, li jintużaw ħafna f'pazjenti b'PAAD, jistgħu jkunu adattati għal pazjenti b'riskju għoli b'PAAD.[33].Zhang et al sabu li mutazzjonijiet fi kwalunkwe mogħdija ta 'rispons għall-ħsara tad-DNA (DDR) jistgħu jwasslu għal pronjosi ħażina f'pazjenti bil-kanċer tal-prostata [39].Il-prova Pancreatic Cancer Olaparib Ongoing (POLO) wera li t-trattament ta' manteniment b'olaparib tawwal is-sopravivenza mingħajr progressjoni meta mqabbel ma' plaċebo wara kimoterapija tal-ewwel linja bbażata fuq il-platinu f'pazjenti b'adenokarċinoma tal-kankrea tal-frixa u mutazzjonijiet ġerminali BRCA1/2 [40].Dan jipprovdi ottimiżmu sinifikanti li r-riżultati tat-trattament se jitjiebu b'mod sinifikanti f'dan is-sottogrupp ta' pazjenti.F'dan l-istudju, il-valur IC50 ta 'AZD.2281 (olaparib) kien ogħla fil-grupp ta' riskju għoli, li jindika li pazjenti PAAD fil-grupp ta 'riskju għoli jistgħu jkunu reżistenti għat-trattament b'AZD.2281.
Il-mudelli ta' tbassir f'dan l-istudju jipproduċu riżultati tajbin ta' tbassir, iżda huma bbażati fuq tbassir analitiku.Kif tikkonferma dawn ir-riżultati b'dejta klinika hija mistoqsija importanti.L-ultrasonografija endoskopika ta 'aspirazzjoni ta' labra fina (EUS-FNA) saret metodu indispensabbli għad-dijanjosi ta 'leżjonijiet solidi u extrapankreatiċi tal-frixa b'sensittività ta' 85% u speċifiċità ta '98% [41].Il-miġja tal-labar tal-bijopsija bil-labra fina EUS (EUS-FNB) hija bbażata prinċipalment fuq vantaġġi perċepiti fuq FNA, bħal preċiżjoni dijanjostika ogħla, il-kisba ta 'kampjuni li jippreservaw l-istruttura istoloġika, u b'hekk jiġġeneraw tessut immuni li huwa kritiku għal ċerti dijanjosi.tbajja speċjali [42].Reviżjoni sistematika tal-letteratura kkonfermat li labar FNB (speċjalment 22G) juru l-ogħla effiċjenza fil-ħsad tat-tessuti minn mases pankreatiċi [43].Klinikament, numru żgħir biss ta 'pazjenti huma eliġibbli għal kirurġija radikali, u l-biċċa l-kbira tal-pazjenti għandhom tumuri inoperabbli fil-ħin tad-dijanjosi inizjali.Fil-prattika klinika, proporzjon żgħir biss ta 'pazjenti huma adattati għal kirurġija radikali minħabba li ħafna pazjenti għandhom tumuri inoperabbli fil-ħin tad-dijanjosi inizjali.Wara konferma patoloġika minn EUS-FNB u metodi oħra, normalment jintgħażel trattament standardizzat mhux kirurġiku bħal kimoterapija.Il-programm ta 'riċerka sussegwenti tagħna huwa li jittestja l-mudell pronjostiku ta' dan l-istudju f'koorti kirurġiċi u mhux kirurġiċi permezz ta 'analiżi retrospettiva.
B'mod ġenerali, l-istudju tagħna stabbilixxa mudell ta 'riskju pronjostiku ġdid ibbażat fuq irlncRNA paired, li wera valur pronjostiku promettenti f'pazjenti b'kanċer tal-frixa.Il-mudell tar-riskju pronjostiku tagħna jista 'jgħin biex jiddifferenzja pazjenti b'PAAD li huma adattati għal trattament mediku.
Is-settijiet tad-dejta użati u analizzati fl-istudju attwali huma disponibbli mill-awtur korrispondenti fuq talba raġonevoli.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Ir-rwol ta 'medjatur tal-awtoeffikaċja fir-regolazzjoni emozzjonali tal-emozzjonijiet negattivi matul il-pandemija tal-COVID-19: studju trasversali.Int J Ment Health Nurs [artiklu tal-ġurnal].2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, et al.Fehmiet tal-membri tal-familja dwar it-teħid ta' deċiżjonijiet alternattiv f'unitajiet ta' kura intensiva: reviżjoni sistematika.INT J NURS STUD [artiklu tar-rivista;reviżjoni].2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Kanċer tal-frixa.Lancet.[Artiklu tal-ġurnal;appoġġ għar-riċerka, NIH, extramural;appoġġ għar-riċerka, gvern barra l-Istati Uniti;reviżjoni].2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemjoloġija tal-kanċer tal-frixa.Ġurnal Dinji tal-Gastroenteroloġija.[Artiklu tal-ġurnal, reviżjoni].2016 28/11/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Nomogramma ġdida relatata mat-tp53 għat-tbassir tas-sopravivenza ġenerali f'pazjenti b'kanċer tal-frixa.BMC Cancer [artiklu tal-ġurnal].2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Effett ta 'terapija ffukata fuq soluzzjoni fuq għeja relatata mal-kanċer f'pazjenti bil-kanċer tal-kolorektum li qed jirċievu kimoterapija: prova kkontrollata randomised.Infermiera tal-kanċer.[Artiklu tal-ġurnal;prova kkontrollata randomised;l-istudju huwa appoġġjat minn gvern barra l-Istati Uniti].2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, et al.Il-livelli ta' antiġenu karċinoembrijoniku (CEA) wara l-operazzjoni jbassru riżultat wara r-resezzjoni tal-kanċer tal-kolorektum f'pazjenti b'livelli normali ta' CEA qabel l-operazzjoni.Ċentru għar-Riċerka Translazzjonali tal-Kanċer.[Artiklu tal-ġurnal].2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, et al.LncRNAs relatati mal-immunità jiġġeneraw firem ġodda u jbassru l-pajsaġġ immuni tal-karċinoma epatoċellulari tal-bniedem.Mol Ther Aċidi Nukleiċi [artiklu tal-ġurnal].2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Immunoterapija għall-kanċer tal-frixa: ostakli u skoperti.Ann Kirurgu Gastrointestinali [Artiklu tal-Ġurnal;reviżjoni].2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. Long non-coding RNAs (LncRNAs), ġenomika tat-tumur virali u avvenimenti ta 'splicing aberranti: implikazzjonijiet terapewtiċi.AM J CANCER RES [artiklu tal-ġurnal;reviżjoni].2021 20/01/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Identifikazzjoni ta 'firem lncRNA assoċjati ma' pronjosi tal-kanċer endometrijali.Kisbiet tax-xjenza [artiklu tar-rivista].2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, et al.Analiżi komprensiva tal-ġeni pronjostiċi tal-proteini li jorbtu l-RNA u l-kandidati tad-droga fil-karċinoma taċ-ċelluli tal-kliewi taċ-ċelluli papillari.pregen.[Artiklu tal-ġurnal].2021 20/01/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, et al.Karatteristiċi ta 'RNA twil mhux kodifikati relatati mal-awtofaġija jbassru pronjosi tal-kanċer tas-sider.pregen.[Artiklu tal-ġurnal].2021 20/01/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Il-firma ta 'sitt lncRNA relatata mal-immunità ttejjeb il-pronjosi fil-glioblastoma multiforme.MOL Newrobijoloġija.[Artiklu tal-ġurnal].2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, et al.Firma ġdida ta 'tri-lncRNA tbassar is-sopravivenza ta' pazjenti b'kanċer tal-frixa.RAPPREŻENTANTI TA' ONKOL.[Artiklu tal-ġurnal].2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 jippromwovi l-progressjoni tal-kanċer tal-frixa billi jirregola l-espressjoni LIN28B u l-mogħdija PI3K/AKT permezz ta 'sponged miR-577.Mol Therapeutics - Aċidi nukleiċi.2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al.Feedback pożittiv bejn lncRNA FLVCR1-AS1 u KLF10 jista 'jinibixxi l-progressjoni tal-kanċer tal-frixa permezz tal-mogħdija PTEN/AKT.J JIS Clin Cancer Res.2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Identifikazzjoni ta 'tlettax-il ġene li jbassru sopravivenza ġenerali f'karċinoma epatoċellulari.Biosci Rep [artiklu tal-ġurnal].2021 04/09/2021.
Ħin tal-post: Settembru-22-2023