Il-kanċer tal-frixa huwa wieħed mit-tumuri l-aktar qattiela fid-dinja bi pronjosi ħażina. Għalhekk, huwa meħtieġ mudell ta' tbassir preċiż biex jiġu identifikati pazjenti b'riskju għoli ta' kanċer tal-frixa biex jiġi mfassal it-trattament u tittejjeb il-pronjosi ta' dawn il-pazjenti.
Ksibna d-dejta RNAseq tal-adenokarċinoma pankreatika (PAAD) tat-The Cancer Genome Atlas (TCGA) mid-database Xena tal-UCSC, identifikajna lncRNAs relatati mal-immunità (irlncRNAs) permezz ta' analiżi ta' korrelazzjoni, u identifikajna d-differenzi bejn it-TCGA u t-tessuti normali tal-adenokarċinoma pankreatika. DEirlncRNA) mit-TCGA u l-espressjoni tat-tessut tal-ġenotip (GTEx) tat-tessut pankreatiku. Saru aktar analiżi univarjati u ta' rigressjoni lasso biex jinbnew mudelli ta' firma prognostika. Imbagħad ikkalkulajna l-erja taħt il-kurva u ddeterminajna l-valur ottimali ta' limitu għall-identifikazzjoni ta' pazjenti b'adenokarċinoma pankreatika b'riskju għoli u baxx. Biex inqabblu l-karatteristiċi kliniċi, l-infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni, il-mikroambjent immunosoppressiv, u r-reżistenza għall-kimoterapija f'pazjenti b'kanċer pankreatiku b'riskju għoli u baxx.
Identifikajna 20 par ta' DEirlncRNA u ġbarna l-pazjenti fi gruppi skont il-valur ottimali ta' limitu. Urajna li l-mudell tal-firma pronjostika tagħna għandu prestazzjoni sinifikanti fit-tbassir tal-pronjosi ta' pazjenti b'PAAD. L-AUC tal-kurva ROC hija 0.905 għat-tbassir ta' sena, 0.942 għat-tbassir ta' sentejn, u 0.966 għat-tbassir ta' 3 snin. Pazjenti b'riskju għoli kellhom rati ta' sopravivenza aktar baxxi u karatteristiċi kliniċi agħar. Urajna wkoll li pazjenti b'riskju għoli huma immunosoppressi u jistgħu jiżviluppaw reżistenza għall-immunoterapija. L-evalwazzjoni ta' mediċini kontra l-kanċer bħal paclitaxel, sorafenib, u erlotinib ibbażata fuq għodod ta' tbassir komputazzjonali tista' tkun xierqa għal pazjenti b'riskju għoli b'PAAD.
B'mod ġenerali, l-istudju tagħna stabbilixxa mudell ġdid ta' riskju prognostiku bbażat fuq irlncRNA paired, li wera valur prognostiku promettenti f'pazjenti b'kanċer tal-frixa. Il-mudell ta' riskju prognostiku tagħna jista' jgħin biex jiddistingwi pazjenti b'PAAD li huma adattati għal trattament mediku.
Il-kanċer tal-frixa huwa tumur malinni b'rata baxxa ta' sopravivenza ta' ħames snin u ta' grad għoli. Fil-ħin tad-dijanjosi, ħafna pazjenti jkunu diġà fi stadji avvanzati. Fil-kuntest tal-epidemija tal-COVID-19, it-tobba u l-infermiera jkunu taħt pressjoni enormi meta jikkuraw pazjenti bil-kanċer tal-frixa, u l-familji tal-pazjenti jiffaċċjaw ukoll pressjonijiet multipli meta jieħdu deċiżjonijiet dwar il-kura [1, 2]. Għalkemm saru avvanzi kbar fil-kura tad-DOADs, bħal terapija neoadjuvant, resezzjoni kirurġika, radjuterapija, kimoterapija, terapija molekulari mmirata, u inibituri tal-punti ta' kontroll immuni (ICIs), madwar 9% biss tal-pazjenti jgħixu ħames snin wara d-dijanjosi [3], 4]. Minħabba li s-sintomi bikrija tal-adenokarċinoma tal-frixa mhumiex tipiċi, il-pazjenti ġeneralment jiġu djanjostikati b'metastasi fi stadju avvanzat [5]. Għalhekk, għal pazjent partikolari, kura komprensiva individwalizzata trid tiżen il-vantaġġi u l-iżvantaġġi tal-għażliet kollha ta' kura, mhux biss biex tittawwal is-sopravivenza, iżda wkoll biex tittejjeb il-kwalità tal-ħajja [6]. Għalhekk, mudell ta' tbassir effettiv huwa meħtieġ biex tiġi vvalutata b'mod preċiż il-pronjosi ta' pazjent [7]. Għalhekk, jista' jintgħażel trattament xieraq biex jibbilanċja s-sopravivenza u l-kwalità tal-ħajja tal-pazjenti bil-PAAD.
Il-pronjosi ħażina tal-PAAD hija prinċipalment dovuta għar-reżistenza għall-mediċini tal-kimoterapija. Fi snin reċenti, l-inibituri tal-punti ta' kontroll immuni ntużaw ħafna fit-trattament ta' tumuri solidi [8]. Madankollu, l-użu tal-ICIs fil-kanċer tal-frixa rarament ikun ta' suċċess [9]. Għalhekk, huwa importanti li jiġu identifikati pazjenti li jistgħu jibbenefikaw mit-terapija tal-ICI.
RNA twil mhux kodifikanti (lncRNA) huwa tip ta' RNA mhux kodifikanti bi traskrizzjonijiet >200 nukleotidi. L-LncRNAs huma mifruxa u jikkostitwixxu madwar 80% tat-traskrizzjoni umana [10]. Korp kbir ta' xogħol wera li mudelli prognostiċi bbażati fuq lncRNA jistgħu jbassru b'mod effettiv il-prognożi tal-pazjent [11, 12]. Pereżempju, ġew identifikati 18-il lncRNA relatati mal-awtofaġija biex jiġġeneraw firem prognostiċi fil-kanċer tas-sider [13]. Sitt lncRNAs oħra relatati mal-immunità ntużaw biex jistabbilixxu l-karatteristiċi prognostiċi tal-glioma [14].
Fil-kanċer tal-frixa, xi studji stabbilew firem ibbażati fuq lncRNA biex ibassru l-prognożi tal-pazjent. Ġiet stabbilita firma ta' 3-lncRNA f'adenokarċinoma tal-frixa b'erja taħt il-kurva ROC (AUC) ta' 0.742 biss u sopravivenza ġenerali (OS) ta' 3 snin [15]. Barra minn hekk, il-valuri tal-espressjoni tal-lncRNA jvarjaw fost ġenomi differenti, formati ta' dejta differenti, u pazjenti differenti, u l-prestazzjoni tal-mudell predittiv hija instabbli. Għalhekk, nużaw algoritmu ta' mmudellar ġdid, tqabbil u iterazzjoni, biex niġġeneraw firem tal-lncRNA relatati mal-immunità (irlncRNA) biex noħolqu mudell predittiv aktar preċiż u stabbli [8].
Id-dejta normalizzata tal-RNAseq (FPKM) u d-dejta klinika tat-TCGA tal-kanċer tal-frixa u l-espressjoni tat-tessut tal-ġenotip (GTEx) inkisbu mid-database UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/). Il-fajls GTF inkisbu mid-database Ensembl (http://asia.ensembl.org) u ntużaw biex jiġu estratti profili ta' espressjoni tal-lncRNA minn RNAseq. Niżżilna ġeni relatati mal-immunità mid-database ImmPort (http://www.immport.org) u identifikajna lncRNAs relatati mal-immunità (irlncRNAs) bl-użu ta' analiżi ta' korrelazzjoni (p < 0.001, r > 0.4). Identifikazzjoni ta' irlncRNAs espressi b'mod differenzjali (DEirlncRNAs) billi nkroċjaw irlncRNAs u lncRNAs espressi b'mod differenzjali miksuba mid-database GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) fil-koorti TCGA-PAAD (|logFC| > 1 u FDR) <0.05).
Dan il-metodu ġie rrappurtat qabel [8]. Speċifikament, aħna nibnu X biex nissostitwixxu l-lncRNA A u lncRNA B imqabbla. Meta l-valur tal-espressjoni tal-lncRNA A jkun ogħla mill-valur tal-espressjoni tal-lncRNA B, X jiġi definit bħala 1, inkella X jiġi definit bħala 0. Għalhekk, nistgħu niksbu matriċi ta' 0 jew – 1. L-assi vertikali tal-matriċi jirrappreżenta kull kampjun, u l-assi orizzontali jirrappreżenta kull par DEirlncRNA b'valur ta' 0 jew 1.
Analiżi ta' rigressjoni univarjata segwita minn rigressjoni Lasso ntużat biex jiġu skrinjati l-pari pronjostiċi ta' DEirlncRNA. L-analiżi ta' rigressjoni lasso użat validazzjoni inkroċjata ta' 10 darbiet ripetuta 1000 darba (p < 0.05), b'1000 stimulu każwali għal kull ġirja. Meta l-frekwenza ta' kull par DEirlncRNA qabżet il-100 darba f'1000 ċiklu, il-pari ta' DEirlncRNA ntgħażlu biex jinbena mudell ta' riskju pronjostiku. Imbagħad użajna l-kurva AUC biex insibu l-valur limitu ottimali għall-klassifikazzjoni tal-pazjenti PAAD fi gruppi ta' riskju għoli u baxx. Il-valur AUC ta' kull mudell ġie wkoll ikkalkulat u pplottjat bħala kurva. Jekk il-kurva tilħaq l-ogħla punt li jindika l-valur massimu tal-AUC, il-proċess tal-kalkolu jieqaf u l-mudell jitqies bħala l-aħjar kandidat. Inbnew mudelli ta' kurva ROC ta' sena, 3 snin u 5 snin. Analiżi ta' rigressjoni univarjata u multivarjata ntużaw biex jeżaminaw il-prestazzjoni predittiva indipendenti tal-mudell ta' riskju pronjostiku.
Uża seba' għodod biex tistudja r-rati ta' infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni, inklużi XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, u CIBERSORT. Id-dejta dwar l-infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni tniżżlet mid-database TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3). Id-differenza fil-kontenut ta' ċelluli li jinfiltraw is-sistema immuni bejn il-gruppi ta' riskju għoli u baxx tal-mudell mibni ġiet analizzata bl-użu tat-test Wilcoxon signed-rank, ir-riżultati huma murija fil-graff kwadru. Twettqet analiżi ta' korrelazzjoni Spearman biex tiġi analizzata r-relazzjoni bejn il-valuri tal-punteġġ tar-riskju u ċ-ċelluli li jinfiltraw is-sistema immuni. Il-koeffiċjent ta' korrelazzjoni li jirriżulta huwa muri bħala lollipop. Il-limitu ta' sinifikat ġie ssettjat għal p < 0.05. Il-proċedura twettqet bl-użu tal-pakkett R ggplot2. Biex neżaminaw ir-relazzjoni bejn il-mudell u l-livelli ta' espressjoni tal-ġeni assoċjati mar-rata ta' infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni, wettaqna l-pakkett ggstatsplot u l-viżwalizzazzjoni tal-plott tal-vjolin.
Biex nevalwaw ix-xejriet ta' trattament kliniku għall-kanċer tal-frixa, ikkalkulajna l-IC50 ta' drogi ta' kimoterapija użati b'mod komuni fil-koorti TCGA-PAAD. Id-differenzi f'nofs konċentrazzjonijiet inibitorji (IC50) bejn gruppi ta' riskju għoli u baxx tqabblu bl-użu tat-test Wilcoxon signed-rank, u r-riżultati huma murija bħala boxplots iġġenerati bl-użu ta' pRRophetic u ggplot2 f'R. Il-metodi kollha jikkonformaw mal-linji gwida u n-normi rilevanti.
Il-fluss tax-xogħol tal-istudju tagħna huwa muri fil-Figura 1. Bl-użu ta' analiżi ta' korrelazzjoni bejn l-lncRNAs u l-ġeni relatati mal-immunità, għażilna 724 irlncRNA b'p < 0.01 u r > 0.4. Imbagħad analizzajna l-lncRNAs espressi b'mod differenzjali ta' GEPIA2 (Figura 2A). Total ta' 223 irlncRNA ġew espressi b'mod differenzjali bejn l-adenokarċinoma pankreatika u t-tessut pankreatiku normali (|logFC| > 1, FDR < 0.05), imsejħa DEirlncRNAs.
Kostruzzjoni ta' mudelli ta' riskju predittiv. (A) Plott vulkan ta' lncRNAs espressi b'mod differenzjali. (B) Distribuzzjoni ta' koeffiċjenti lasso għal 20 par DEirlncRNA. (Ċ) Varjanza parzjali tal-probabbiltà tad-distribuzzjoni tal-koeffiċjent LASSO. (D) Plott foresta li juri analiżi ta' rigressjoni univarjata ta' 20 par DEirlncRNA.
Imbagħad bnejna matriċi ta' 0 jew 1 billi għaqqadna 223 DEirlncRNA. Ġew identifikati total ta' 13,687 par ta' DEirlncRNA. Wara analiżi ta' rigressjoni univarjata u lasso, 20 par ta' DEirlncRNA ġew finalment ittestjati biex jinbena mudell ta' riskju prognostiku (Figura 2B-D). Abbażi tar-riżultati tal-analiżi Lasso u ta' rigressjoni multipla, ikkalkulajna punteġġ ta' riskju għal kull pazjent fil-koorti TCGA-PAAD (Tabella 1). Abbażi tar-riżultati tal-analiżi ta' rigressjoni lasso, ikkalkulajna punteġġ ta' riskju għal kull pazjent fil-koorti TCGA-PAAD. L-AUC tal-kurva ROC kienet 0.905 għat-tbassir tal-mudell ta' riskju ta' sena, 0.942 għat-tbassir ta' sentejn, u 0.966 għat-tbassir ta' 3 snin (Figura 3A-B). Stabbilixxejna valur ta' limitu ottimali ta' 3.105, stratifikajna l-pazjenti tal-koorti TCGA-PAAD fi gruppi ta' riskju għoli u baxx, u pplottjajna r-riżultati tas-sopravivenza u d-distribuzzjonijiet tal-punteġġ tar-riskju għal kull pazjent (Figura 3C-E). L-analiżi ta' Kaplan-Meier uriet li s-sopravivenza tal-pazjenti PAAD fil-grupp ta' riskju għoli kienet sinifikament aktar baxxa minn dik tal-pazjenti fil-grupp ta' riskju baxx (p < 0.001) (Figura 3F).
Validità tal-mudelli tar-riskju prognostiku. (A) ROC tal-mudell tar-riskju prognostiku. (B) Mudelli tar-riskju prognostiku ROC ta' sena, sentejn, u tliet snin. (Ċ) ROC tal-mudell tar-riskju prognostiku. Juri l-punt ta' qtugħ ottimali. (DE) Distribuzzjoni tal-istatus ta' sopravivenza (D) u punteġġi tar-riskju (E). (F) Analiżi Kaplan-Meier ta' pazjenti PAAD fi gruppi ta' riskju għoli u baxx.
Aħna vvalutajna aktar id-differenzi fil-punteġġi tar-riskju skont il-karatteristiċi kliniċi. Il-plott tal-istrixxa (Figura 4A) juri r-relazzjoni ġenerali bejn il-karatteristiċi kliniċi u l-punteġġi tar-riskju. B'mod partikolari, pazjenti anzjani kellhom punteġġi ta' riskju ogħla (Figura 4B). Barra minn hekk, pazjenti bi stadju II kellhom punteġġi ta' riskju ogħla minn pazjenti bi stadju I (Figura 4C). Rigward il-grad tat-tumur f'pazjenti bil-PAAD, pazjenti bi grad 3 kellhom punteġġi ta' riskju ogħla minn pazjenti bi grad 1 u 2 (Figura 4D). Aħna wettaqna wkoll analiżi ta' rigressjoni univarjata u multivarjata u wrejna li l-punteġġ tar-riskju (p < 0.001) u l-età (p = 0.045) kienu fatturi prognostiċi indipendenti f'pazjenti bil-PAAD (Figura 5A-B). Il-kurva ROC uriet li l-punteġġ tar-riskju kien superjuri għal karatteristiċi kliniċi oħra fit-tbassir tas-sopravivenza ta' sena, sentejn, u tlieta ta' pazjenti bil-PAAD (Figura 5C-E).
Karatteristiċi kliniċi ta' mudelli ta' riskju prognostiku. L-istogramma (A) turi (B) l-età, (C) l-istadju tat-tumur, (D) il-grad tat-tumur, il-punteġġ tar-riskju, u s-sess tal-pazjenti fil-koorti TCGA-PAAD. **p < 0.01
Analiżi predittiva indipendenti ta' mudelli ta' riskju prognostiku. (AB) Analiżi ta' rigressjoni univarjata (A) u multivarjata (B) ta' mudelli ta' riskju prognostiku u karatteristiċi kliniċi. (CE) ROC ta' sena, sentejn, u tliet snin għal mudelli ta' riskju prognostiku u karatteristiċi kliniċi.
Għalhekk, eżaminajna r-relazzjoni bejn il-ħin u l-punteġġi tar-riskju. Sibna li l-punteġġ tar-riskju f'pazjenti bil-PAAD kien korrelatat b'mod invers maċ-ċelloli T CD8+ u ċ-ċelloli NK (Figura 6A), li jindika funzjoni immuni soppressa fil-grupp ta' riskju għoli. Ivvalutajna wkoll id-differenza fl-infiltrazzjoni taċ-ċelloli immuni bejn il-gruppi ta' riskju għoli u baxx u sibna l-istess riżultati (Figura 7). Kien hemm inqas infiltrazzjoni ta' ċelloli T CD8+ u ċelloli NK fil-grupp ta' riskju għoli. Fi snin reċenti, l-inibituri tal-punti ta' kontroll immuni (ICIs) intużaw ħafna fit-trattament ta' tumuri solidi. Madankollu, l-użu tal-ICIs fil-kanċer tal-frixa rarament kien ta' suċċess. Għalhekk, ivvalutajna l-espressjoni tal-ġeni tal-punti ta' kontroll immuni fi gruppi ta' riskju għoli u baxx. Sibna li CTLA-4 u CD161 (KLRB1) kienu espressi żżejjed fil-grupp ta' riskju baxx (Figura 6B-G), li jindika li l-pazjenti bil-PAAD fil-grupp ta' riskju baxx jistgħu jkunu sensittivi għall-ICI.
Analiżi tal-korrelazzjoni tal-mudell tar-riskju prognostiku u l-infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni. (A) Korrelazzjoni bejn il-mudell tar-riskju prognostiku u l-infiltrazzjoni taċ-ċelluli immuni. (BG) Jindika l-espressjoni tal-ġeni fi gruppi ta' riskju għoli u baxx. (HK) Valuri IC50 għal mediċini speċifiċi kontra l-kanċer fi gruppi ta' riskju għoli u baxx. *p < 0.05, **p < 0.01, ns = mhux sinifikanti
Aħna vvalutajna aktar l-assoċjazzjoni bejn il-punteġġi tar-riskju u l-aġenti komuni tal-kimoterapija fil-koorti TCGA-PAAD. Fittixna għal mediċini kontra l-kanċer li jintużaw b'mod komuni fil-kanċer tal-frixa u analizzajna d-differenzi fil-valuri IC50 tagħhom bejn gruppi ta' riskju għoli u baxx. Ir-riżultati wrew li l-valur IC50 ta' AZD.2281 (olaparib) kien ogħla fil-grupp ta' riskju għoli, li jindika li l-pazjenti PAAD fil-grupp ta' riskju għoli jistgħu jkunu reżistenti għat-trattament b'AZD.2281 (Figura 6H). Barra minn hekk, il-valuri IC50 ta' paclitaxel, sorafenib, u erlotinib kienu aktar baxxi fil-grupp ta' riskju għoli (Figura 6I-K). Aħna identifikajna aktar 34 mediċina kontra l-kanċer b'valuri IC50 ogħla fil-grupp ta' riskju għoli u 34 mediċina kontra l-kanċer b'valuri IC50 aktar baxxi fil-grupp ta' riskju għoli (Tabella 2).
Ma jistax jiġi miċħud li l-lncRNAs, l-mRNAs, u l-miRNAs jeżistu b'mod wiesa' u għandhom rwol kruċjali fl-iżvilupp tal-kanċer. Hemm biżżejjed evidenza li tappoġġja r-rwol importanti tal-mRNA jew tal-miRNA fit-tbassir tas-sopravivenza ġenerali f'diversi tipi ta' kanċer. Bla dubju, ħafna mudelli ta' riskju prognostiku huma wkoll ibbażati fuq lncRNAs. Pereżempju, Luo et al. Studji wrew li LINC01094 għandu rwol ewlieni fil-proliferazzjoni u l-metastasi tal-PC, u espressjoni għolja ta' LINC01094 tindika sopravivenza fqira ta' pazjenti bil-kanċer tal-frixa [16]. L-istudju ppreżentat minn Lin et al. Studji wrew li t-tnaqqis fir-regolazzjoni tal-lncRNA FLVCR1-AS1 huwa assoċjat ma' pronjosi ħażina f'pazjenti bil-kanċer tal-frixa [17]. Madankollu, l-lncRNAs relatati mal-immunità huma relattivament inqas diskussi f'termini ta' tbassir tas-sopravivenza ġenerali ta' pazjenti bil-kanċer. Riċentement, ammont kbir ta' xogħol kien iffukat fuq il-bini ta' mudelli ta' riskju prognostiku biex wieħed ibassar is-sopravivenza ta' pazjenti bil-kanċer u b'hekk jaġġusta l-metodi ta' trattament [18, 19, 20]. Hemm rikonoxximent dejjem jikber tar-rwol importanti tal-infiltrati immuni fil-bidu, il-progressjoni u r-rispons tal-kanċer għal trattamenti bħall-kimoterapija. Bosta studji kkonfermaw li ċ-ċelloli immuni li jinfiltraw it-tumur għandhom rwol kritiku fir-rispons għall-kimoterapija ċitotossika [21, 22, 23]. Il-mikroambjent immuni tat-tumur huwa fattur importanti fis-sopravivenza tal-pazjenti bit-tumur [24, 25]. L-immunoterapija, speċjalment it-terapija ICI, tintuża ħafna fit-trattament ta’ tumuri solidi [26]. Ġeni relatati mal-immunità jintużaw ħafna biex jinbnew mudelli ta’ riskju prognostiku. Pereżempju, Su et al. Il-mudell ta’ riskju prognostiku relatat mal-immunità huwa bbażat fuq ġeni li jikkodifikaw il-proteini biex ibassar il-prognożi tal-pazjenti bil-kanċer tal-ovarji [27]. Ġeni mhux kodifikanti bħal lncRNAs huma wkoll adattati għall-bini ta’ mudelli ta’ riskju prognostiku [28, 29, 30]. Luo et al ittestjaw erba’ lncRNAs relatati mal-immunità u bnew mudell ta’ tbassir għar-riskju tal-kanċer ċervikali [31]. Khan et al. Ġew identifikati total ta' 32 traskrizzjoni espressa b'mod differenzjali, u abbażi ta' dan, ġie stabbilit mudell ta' tbassir b'5 traskrizzjonijiet sinifikanti, li ġie propost bħala għodda rakkomandata ħafna għat-tbassir ta' rifjut akut ippruvat permezz ta' bijopsija wara trapjant tal-kliewi [32].
Ħafna minn dawn il-mudelli huma bbażati fuq livelli ta' espressjoni tal-ġeni, jew ġeni li jikkodifikaw il-proteini jew ġeni li ma jikkodifikawx. Madankollu, l-istess ġene jista' jkollu valuri ta' espressjoni differenti f'ġenomi differenti, formati ta' dejta u f'pazjenti differenti, u dan iwassal għal stimi instabbli fil-mudelli predittivi. F'dan l-istudju, bnejna mudell raġonevoli b'żewġ pari ta' lncRNAs, indipendenti mill-valuri eżatti tal-espressjoni.
F'dan l-istudju, identifikajna irlncRNA għall-ewwel darba permezz ta' analiżi ta' korrelazzjoni ma' ġeni relatati mal-immunità. Skrinjajna 223 DEirlncRNA permezz ta' ibridizzazzjoni ma' lncRNAs espressi b'mod differenzjali. It-tieni, bnejna matriċi 0-jew-1 ibbażata fuq il-metodu ppubblikat ta' tqabbil DEirlncRNA [31]. Imbagħad wettaqna analiżi ta' rigressjoni univarjata u lasso biex nidentifikaw pari ta' DEirlncRNA prognostiċi u nibnu mudell ta' riskju predittiv. Analizzajna aktar l-assoċjazzjoni bejn il-punteġġi tar-riskju u l-karatteristiċi kliniċi f'pazjenti b'PAAD. Sibna li l-mudell ta' riskju prognostiku tagħna, bħala fattur prognostiku indipendenti f'pazjenti PAAD, jista' jiddifferenzja b'mod effettiv pazjenti ta' grad għoli minn pazjenti ta' grad baxx u pazjenti ta' grad għoli minn pazjenti ta' grad baxx. Barra minn hekk, il-valuri tal-AUC tal-kurva ROC tal-mudell ta' riskju prognostiku kienu 0.905 għat-tbassir ta' sena, 0.942 għat-tbassir ta' sentejn, u 0.966 għat-tbassir ta' 3 snin.
Ir-riċerkaturi rrappurtaw li pazjenti b'infiltrazzjoni ogħla ta' ċelluli T CD8+ kienu aktar sensittivi għat-trattament bl-ICI [33]. Żieda fil-kontenut ta' ċelluli ċitotossiċi, ċelluli CD56 NK, ċelluli NK u ċelluli T CD8+ fil-mikroambjent immuni tat-tumur tista' tkun waħda mir-raġunijiet għall-effett soppressiv tat-tumur [34]. Studji preċedenti wrew li livelli ogħla ta' CD4(+) T u CD8(+) T li jinfiltraw it-tumur kienu assoċjati b'mod sinifikanti ma' sopravivenza itwal [35]. Infiltrazzjoni fqira ta' ċelluli T CD8, tagħbija baxxa ta' neoantiġen, u mikroambjent tat-tumur immunosoppressiv ħafna wasslu għal nuqqas ta' rispons għat-terapija bl-ICI [36]. Sibna li l-punteġġ tar-riskju kien korrelatat b'mod negattiv maċ-ċelluli T CD8+ u ċ-ċelluli NK, li jindika li pazjenti bi punteġġi ta' riskju għoli jistgħu ma jkunux adattati għat-trattament bl-ICI u jkollhom pronjosi agħar.
CD161 huwa markatur taċ-ċelloli qattiela naturali (NK). Iċ-ċelloli T CD8+CD161+ CAR-trasdotti jwasslu għal effikaċja antitumorali in vivo msaħħa f'mudelli ta' ksenograft ta' adenokarċinoma duttali pankreatika HER2+ [37]. L-inibituri tal-punti ta' kontroll immuni jimmiraw lejn il-proteina assoċjata mal-limfoċiti T ċitotossiċi 4 (CTLA-4) u l-mogħdijiet tal-proteina tal-mewt taċ-ċelloli pprogrammata 1 (PD-1)/ligand tal-mewt taċ-ċelloli pprogrammata 1 (PD-L1) u għandhom potenzjal kbir f'ħafna oqsma. L-espressjoni ta' CTLA-4 u CD161 (KLRB1) hija aktar baxxa fi gruppi ta' riskju għoli, li tindika aktar li pazjenti bi punteġġi ta' riskju għoli jistgħu ma jkunux eliġibbli għal trattament ICI. [38]
Biex insibu għażliet ta’ trattament adattati għal pazjenti b’riskju għoli, analizzajna diversi mediċini kontra l-kanċer u sibna li paclitaxel, sorafenib, u erlotinib, li jintużaw ħafna f’pazjenti b’PAAD, jistgħu jkunu adattati għal pazjenti b’riskju għoli b’PAAD. [33]. Zhang et al sabu li mutazzjonijiet fi kwalunkwe mogħdija ta’ rispons għall-ħsara fid-DNA (DDR) jistgħu jwasslu għal pronjosi ħażina f’pazjenti bil-kanċer tal-prostata [39]. L-istudju Pancreatic Cancer Olaparib Ongoing (POLO) uriet li t-trattament ta’ manutenzjoni b’olaparib tawwal is-sopravivenza mingħajr progressjoni meta mqabbel mal-plaċebo wara kimoterapija bbażata fuq il-platinu tal-ewwel linja f’pazjenti b’adenokarċinoma duttali tal-pankreas u mutazzjonijiet BRCA1/2 tal-linja ġerminali [40]. Dan jipprovdi ottimiżmu sinifikanti li r-riżultati tat-trattament se jitjiebu b’mod sinifikanti f’dan is-sottogrupp ta’ pazjenti. F’dan l-istudju, il-valur IC50 ta’ AZD.2281 (olaparib) kien ogħla fil-grupp b’riskju għoli, li jindika li l-pazjenti PAAD fil-grupp b’riskju għoli jistgħu jkunu reżistenti għat-trattament b’AZD.2281.
Il-mudelli ta’ tbassir f’dan l-istudju jipproduċu riżultati tajbin ta’ tbassir, iżda huma bbażati fuq tbassir analitiku. Kif jiġu kkonfermati dawn ir-riżultati b’dejta klinika hija kwistjoni importanti. L-ultrasonografija endoskopika b’aspirazzjoni fina bil-labra (EUS-FNA) saret metodu indispensabbli għad-dijanjosi ta’ leżjonijiet pankreatiċi solidi u extrapankreatiċi b’sensittività ta’ 85% u speċifiċità ta’ 98% [41]. Il-miġja tal-labar tal-bijopsija bil-labra fina EUS (EUS-FNB) hija prinċipalment ibbażata fuq vantaġġi perċepiti fuq l-FNA, bħal preċiżjoni dijanjostika ogħla, kisba ta’ kampjuni li jippreservaw l-istruttura istoloġika, u b’hekk ġenerazzjoni ta’ tessut immuni li huwa kritiku għal ċerti dijanjożi. tebgħa speċjali [42]. Reviżjoni sistematika tal-letteratura kkonfermat li l-labar FNB (speċjalment 22G) juru l-ogħla effiċjenza fil-ħsad ta’ tessut minn mases pankreatiċi [43]. Klinikament, numru żgħir biss ta’ pazjenti huma eliġibbli għal kirurġija radikali, u ħafna pazjenti għandhom tumuri inoperabbli fil-ħin tad-dijanjosi inizjali. Fil-prattika klinika, proporzjon żgħir biss ta’ pazjenti huma adattati għal kirurġija radikali għaliex ħafna pazjenti għandhom tumuri inoperabbli fil-ħin tad-dijanjosi inizjali. Wara konferma patoloġika permezz ta' EUS-FNB u metodi oħra, ġeneralment jintgħażel trattament mhux kirurġiku standardizzat bħall-kimoterapija. Il-programm ta' riċerka sussegwenti tagħna huwa li nittestjaw il-mudell prognostiku ta' dan l-istudju f'koorti kirurġiċi u mhux kirurġiċi permezz ta' analiżi retrospettiva.
B'mod ġenerali, l-istudju tagħna stabbilixxa mudell ġdid ta' riskju prognostiku bbażat fuq irlncRNA paired, li wera valur prognostiku promettenti f'pazjenti b'kanċer tal-frixa. Il-mudell ta' riskju prognostiku tagħna jista' jgħin biex jiddistingwi pazjenti b'PAAD li huma adattati għal trattament mediku.
Is-settijiet tad-dejta użati u analizzati fl-istudju attwali huma disponibbli mingħand l-awtur korrispondenti fuq talba raġonevoli.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Ir-rwol ta' medjazzjoni tal-awtoeffikaċja fir-regolazzjoni emozzjonali tal-emozzjonijiet negattivi matul il-pandemija tal-COVID-19: studju trasversali. Int J Ment Health Nurs [artiklu ta' ġurnal]. 2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, et al. L-opinjonijiet tal-membri tal-familja dwar it-teħid ta' deċiżjonijiet alternattivi f'unitajiet tal-kura intensiva: reviżjoni sistematika. INT J NURS STUD [artiklu f'rivista; reviżjoni]. 2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Kanċer tal-frixa. Lancet. [Artiklu f'ġurnal; appoġġ għar-riċerka, NIH, extramurali; appoġġ għar-riċerka, gvern barra l-Istati Uniti; reviżjoni]. 2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemjoloġija tal-kanċer tal-frixa. Ġurnal Dinji tal-Gastroenteroloġija. [Artiklu f'ġurnal, reviżjoni]. 2016 28/11/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Nomogramma ġdida relatata mat-tp53 għat-tbassir tas-sopravivenza ġenerali f'pazjenti b'kanċer tal-frixa. BMC Cancer [artiklu f'ġurnal]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Effett ta' terapija ffukata fuq is-soluzzjoni fuq l-għeja relatata mal-kanċer f'pazjenti bil-kanċer kolorektali li jirċievu kimoterapija: prova kkontrollata każwali. Infermier tal-kanċer. [Artiklu f'ġurnal; prova kkontrollata każwali; l-istudju huwa appoġġjat minn gvern barra l-Istati Uniti]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, et al. Il-livelli ta' antiġen karċinoembrijoniku (CEA) wara l-operazzjoni jbassru r-riżultat wara resezzjoni tal-kanċer kolorektali f'pazjenti b'livelli normali ta' CEA qabel l-operazzjoni. Ċentru għar-Riċerka Traslazzjonali dwar il-Kanċer. [Artiklu fil-ġurnal]. 2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, et al. LncRNAs relatati mas-sistema immunitarja jiġġeneraw firem ġodda u jbassru l-pajsaġġ immuni tal-karċinoma epatoċellulari umana. Mol Ther Nucleic acids [Artiklu fil-ġurnal]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Immunoterapija għall-kanċer tal-frixa: ostakli u skoperti ġodda. Ann Gastrointestinal Surgeon [Artiklu fil-Ġurnal; reviżjoni]. 2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. RNAs twal mhux kodifikanti (LncRNAs), ġenomika tat-tumuri virali u avvenimenti aberranti ta' splicing: implikazzjonijiet terapewtiċi. AM J CANCER RES [artiklu f'ġurnal; reviżjoni]. 2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Identifikazzjoni ta' firem tal-lncRNA assoċjati mal-pronjosi tal-kanċer endometrijali. Kisbiet tax-xjenza [artiklu f'rivista]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, et al. Analiżi komprensiva tal-ġeni prognostiċi tal-proteini li jorbtu l-RNA u l-kandidati għall-mediċini fil-karċinoma taċ-ċelluli papillari tal-kliewi. pregen. [Artiklu fil-ġurnal]. 2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, et al. Il-karatteristiċi ta' RNA twil mhux kodifikanti relatat mal-awtofaġija jbassru l-prognożi tal-kanċer tas-sider. pregen. [Artiklu fil-ġurnal]. 2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Firma ta' sitt lncRNA relatata mas-sistema immunitarja ttejjeb il-prognożi fil-glioblastoma multiforme. MOL Neurobiology. [Artiklu f'ġurnal]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, et al. Firma ġdida ta' tri-lncRNA tbassar is-sopravivenza ta' pazjenti b'kanċer tal-frixa. RAPPREŻENTANTI TA' ONKOL. [Artiklu ta' ġurnal]. 2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 jippromwovi l-progressjoni tal-kanċer tal-frixa billi jirregola l-espressjoni ta' LIN28B u l-mogħdija PI3K/AKT permezz ta' miR-577 sponżat. Mol Therapeutics – Aċidi nukleiċi. 2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al. Rispons pożittiv bejn lncRNA FLVCR1-AS1 u KLF10 jista' jinibixxi l-progressjoni tal-kanċer tal-frixa permezz tal-mogħdija PTEN/AKT. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Identifikazzjoni ta' tlettax-il ġene li jbassru s-sopravivenza ġenerali fil-karċinoma epatoċellulari. Biosci Rep [artiklu ta' ġurnal]. 2021 04/09/2021.
Ħin tal-posta: 22 ta' Settembru 2023